天才少年泽田弘树因不喜欢日本的教育跟随母亲来到美国，但母亲因病早亡，随即被辛多拉董事长收养。但弘树得知辛多拉原来是开膛手杰克子孙，辛多拉于是打算杀人灭口。弘树在完成名为“诺亚方舟”的人工智能系统后跳楼自杀。 两年后，辛多拉公司研究的新型体感游戏“茧”发表，特殊诊疗科室特殊待遇3邀请了日本精英阶层50名后代体验游戏。游戏开始后被弘树研究的诺亚方舟所操控，如果50个孩子没能成功完成游戏，所有人都会死去。这时游戏的研发者之一的坚村（弘树的父亲）被人杀害（凶手是辛多拉，原因是被知道了上面的秘密杀人灭口）。 最后柯南在游戏里面上世纪的伦敦、工藤优作在现实中梦幻联动分别破案。 整体设定很牛逼很超前，特殊诊疗科室特殊待遇3虽然有些地方不是很合理，但就凭这个设定就可以给五颗星。对现实社会阶层进行了讽刺。那些“坏”小孩知错能改和众人的牺牲蛮感人的。